常见的电泳仪分为以下几种：
毛细管电泳仪
毛细管电泳仪主要组成有0～30kV可调稳压稳流电源，内径小于100um(常用50～75um)、长度一般为30～100cm的弹性石英毛细管、电极槽、检测器和进样装置。
检测器有紫外/可见分光检测器、激光诱导荧光检测器和电化学检测器，前者最为常用。进样方法有电动法(电迁移)、压力法(正压力、负压力)和虹吸法。成套仪器还配有自动冲洗、自动进样、温度控制、数据采集和处理等部件。
常规电泳仪
其组成部件为可调稳压稳流电源，垂直电泳槽，水平电泳槽，电极连接线，支持体（其中非凝胶性支持体区带电泳，支持体有： 淀粉、纤维素粉 、玻璃粉、硅胶等 ;凝胶支持体区带电泳支持体有： 淀粉液、聚丙烯酰胺凝胶 、琼脂(糖)凝胶 ）陶瓷板，抽水泵，输水管，冰水曹等部件组成。
其他电泳仪
Tiselius（微量电泳)、显微电泳 、等电点聚焦电泳、等速电泳、密度梯度电泳等。是一种非支持体的电泳仪也称为自由电泳法的发展并不迅速，因为其电泳仪构造复杂、体积庞大，操作要求严格，价格昂贵等很少使用。