核酸内切酶IV来源于E.coli，是一种32 kDa的金属蛋白，参与DNA损伤修复。该酶是一个脱嘌呤/脱嘧啶（AP）核酸内切酶，识别AP位点，并切割AP位点5´端的位列前茅个磷酸二酯键，产生3´羟基和5´脱氧核糖磷酸末端。此外该酶也具有3´二酯酶活性，可以从DNA的3´末端释放磷酸甘油醛、完整的脱氧核糖5´-磷酸和磷酸。
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