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小麦GAPDH截短体重组与表达

2016/4/1 11:44:10      来宝商城

(一) 实验及仪器:


高速冷冻离心机、低温冰箱、液氮罐、研钵、剪刀、镊子、PCR扩增仪、台式离心、恒温水浴锅、微量移液器、培养皿、带帽试管、涂布器、无菌操作台(含酒精灯、接种环、灭菌牙签等)、恒温摇床、1.4ml EP 管、培养皿、电转印、摇床、紫外灯、恒温水浴箱、电泳仪系统、凝胶成像系统等


(一) 实验步骤:

1. 小麦总 RNA 提取(Trizol 法)

1.1 材料:小麦幼苗 

1.2 试剂配制及器具处理 

① 0.1%的 DEPC H2ODEPC:焦碳酸二乙酯) 

② 器具处理:试剂瓶、量筒、研钵、大小枪头和 1.5ml  0.2ml  EP 管等用纱布刀、镊子和药匙等 160烘烤 6h 以上。

③  RNA 酶灭菌水(DEPC H2O):用将高温烘烤的玻璃瓶 (180×2h)装蒸馏水,然后加入 0.1% DEPC(体积/体积),处理过夜后高压灭菌。

④ Trizol 试剂

⑤ 75%乙醇:用新打开的无水乙醇和 DEPC 处理过的水配制 75%乙醇(用高温灭菌器皿配制),然后装入高温烘烤的玻璃瓶中,存放于低温冰箱。

⑥ 氯仿最好用新的

⑦ 异丙醇最好用新的 

1.3 操作步骤 

1.3.1 Trizol 法提取总 RNA

① 先在研钵中加入液氮,再将小麦叶片剪成小段在液氮中磨成粉末,用液氮预冷的药匙取 50100mg 组织粉末加入已盛有 1ml  Trizol 液的 EP 管中(注意研磨粉末总体积不能超过所用 Trizol 体积的 10%),充分混合均匀。

② 室温放置 5min,然后加入 200µL 的氯仿,盖紧 EP 管并剧烈摇荡 15 秒钟。

③ 12000rpm 离心 10min,取上层水相于一新的 EP 管中 (千万不要将中间的沉淀层和下层液混入,否则重新离心分离),加入 500µL 异丙醇,温和颠倒混匀。室温放置 10min12000rpm 离心 10min 

④ 小心地弃去上清液,加入 1ml  75%乙醇,涡旋混匀,4 12000rpm 离心 5min 

⑤ 重复步骤 

⑥ 弃去上清液(尽量将残余液体除去),室温或真空干燥 5~10min (注意不要干燥过分,否则会降低 RNA 的溶解度)。用 30µL DEPC 处理过的水将 RNA 溶解,必要时可 5560 水浴10 minRNA 可进行 mRNA 分离,或贮存于 70%乙醇并保存于-70 

[注意]

① 整个操作要带口罩及一次性手套,并尽可能在低温下操作。

② 加氯仿前的匀浆液可在-70保存一个月以上RNA 沉淀在70%,乙醇中可在 4保存一周,-20保存一年。

2. RT-PCR 扩增目的基因 cDNA

2.1 试剂 


① RNA 模板 

② Olig (dT)18 

③ 反转录缓冲液 

④ dNTP

⑤ M-MULV 反转录酶 

⑥ RNA 抑制剂(RNasin 

⑦ Premix EX Taq DNA 聚合酶 

⑧ PCR 特异引物 


2.2 操作步骤 

1.1.1 RNA 的反转录 

采用 Thermo Scientific (Fermentas) RevertAid First Strand cDNA Synthesis Kit


6µL(需加入 RNA  1mg

Total RNA

1µL

Oligo dT primer

5µL

H2Onuclease-free

12µL

65 5min,补加下列试剂:


5× Reaction buffer

4µL

Ribolock RNase Inhibitor

1µL

10mM dNTP Mix

2µL

RevertAid M-MuLV Reverse Transcriptase

1µL


20µL

42  60min


705min-20保存


1.1.2 PCR 扩增目的基因 

1.1.2.1 用表达引物扩增目的基因(25µL 体系)

2×PCR Mix

12.5

cDNA

1

引物 GAPDH1-1

1

引物 GAPDH1-2

1

ddH2O

9.5

total

25µL

PCR程序:

95℃  1min

95℃  10s

58℃  20s  35cycles

72℃  45s

72℃  10min

16℃

PCR产物进行电泳并做胶回收


标签:重组基因表达      阅读量:609
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