一.（1）CTAB缓冲液方法
这是最广泛地用来分离植物DNA的方法，对大多数植物种都适用，特别是当样本数量很小时。
此法运用阳离子去污剂CTAB溶解植物细胞膜并与DNA形成一复合物。其优点是不需要准备大量的植物组织，而且适合像叶、根、种子、胚、胚乳、花粉和悬浮培养的组织等多种类型的组织。另外，此法对样品数量的要求也不高，从小到毫克数量的标本（木乃伊、化石）许多克的新鲜材料均可使用。
步骤 ：
1、加热分离缓冲液、研钵、研杵到60℃。
2、在热研钵中放人0.5-1.5g新鲜或冰冻的叶子，用7.5ml2倍CTAB分离缓冲液研磨(可加些石英砂帮助研磨).对冻干的组织用1倍CTAB缓冲液研磨。把研碎的组织倒入50ml管中，再用0.5ml 2倍CTAB缓冲液冲洗研钵将冲洗液加到管中。
3、将试管在60℃下放置30-60分钟，然后轻轻振荡，使之充分混合后降至室温。
4、在试管中加入10ml氯仿-异戊醇24:1萃取液（如颜色深可再进行一次）轻轻摇晃使其混合在室温下1500r/min离心5分钟，使其分相。
5、将上层的水相倒入，15ml管中 加2/3体积的冷异丙醇，轻轻混合以沉淀核酸。（如果看不到核酸沉淀可在20℃下放置20分钟或更长时间）
6、室温下 800r/min离心 3-5分钟，如果看不到小团或沉淀，可在-20℃下放置 20分钟再离心。
7、小心地倒掉上清液，不要倒掉核酸，这时的核酸一般松散地贴在管的底部加 15ml清洗缓冲液轻轻地旋转清洗沉淀物15-20分钟后核酸将变得更白。
8、室温下800r/min离心5分钟。如不充分，则加大离心速度或延长离心时间。倒掉清洗缓冲液，将管倒扣在纸巾上，让沉淀物干燥，小心不要让DNA滑掉。
9、按沉淀物的大小用少量悬浮缓冲液（10-100 µl）悬浮DNA。
10、用100µg/ml RNAase在 37℃下温育 30-60分钟。
11、如果组织包含单宁或其他次级产物，可以对 DNA作进一步纯化。可用氯仿、苯酚纯化。一些材料可能需要用氯铯 CsCl梯度纯化。上述方法也可以进行改进，像巯基乙醇的浓度可以提高至 25mmol/dm也 可加入 l%的抗坏血酸、DTT等。CTAB也可用 SDS取代也可用 TE（10mmol/dm3Tris-HCIpH值 8.0lmmol/dm3EDTA）作悬浮缓冲液。
（2）CTAB沉淀法
步骤 ：
1、与上方法中中前4个步骤同。
2、吸取上层水相，将其例入一个15ml管中。
3、加 3倍体积的沉淀缓冲液，使NaCI的浓度减少到 0.35mol/dm3 室温下放置 30分钟。
4、室温下 2 000r/min离心 5分钟，以沉淀 DNA。
5、根据沉淀物的大小，用少量的悬浮缓冲液（10-100µl）悬浮DNA。
6、虽然氯仿或苯酚提取DNA是有效的，但是对那些包含单宁或其他次级产物的组织，可以在氯化铯梯度上进一步纯化。
二.蛋白质沉淀方法
这个方法可以产生高质量的DNA但产量也是最低的。一般在沉淀核酸之前用乙酸钾沉淀蛋白质和多糖此方法不需要有机提取而且快速所以对大量样品比较合适。
步骤 ：
1、用液氮在研钵中研磨1.0g新鲜叶子.可以加一些石英砂帮助研磨。将研磨完毕的粉末贮存在-80℃冰箱中，在加提取液之前，不要让植物材料融化。
2、在冰冻的组织中加 6ml提取缓冲液，转到一个15ml的离心管中，充分振荡大约 30秒钟，使之混合均匀，然后在65℃下放置20分钟。
3、往管中加入2ml 5mol/dm3乙酸钾，（pH值6.5）充分摇匀，在冰水中放置5分钟。随着不溶的十二烷基硫酸钾的沉淀，大部分蛋白质和多糖作为复合物被除去了。
4、在 4℃下 2 000r/min离心 20分钟。
5、吸出上清液，将其倒入一个干净的 15ml的离心管中，不要带入颗粒物质，然后加 4ml异丙醇轻轻混合，在-20℃下放置。
6、在4℃下 2 000r/min离心 15秒钟，DNA沉淀后轻轻地倒掉上清液，在纸巾上倒扣10分钟或更长时间，以干燥沉淀物。
7、将沉淀物放在 100TE中溶解，然后将溶液倒入一个1、sml离心管中，离心 5分钟，移去不溶的沉淀。
8、将管中上清液倒入另一个 1.5ml离心管中，加 75µl 3mol/dm3NaAcpH值 7.6和500µl冷异丙醇，充分混合，在—20℃下放置1-2小时，拿出后再在室温下放10秒钟，使管中DNA沉淀。
9、用 500µl 80乙醇洗沉淀物 10分钟，离心 1分钟干燥沉淀物 10分钟。
10、根据DNA沉淀物的大小用少量的 TE（10-100µl）溶解DNA。
三、氯化铯方法
这个方法的原理是根据在氯化铯（CsCl）中的不同密度梯度来分离细胞成分。此方法
可以产生大量高纯度的DNA，但费时，而且需昂贵的仪器设备，对需要复杂的有机提取或
沉淀的材料比较适合在一些情况下。它可能是在含大量次级产物的植物中提取高质量DNA的唯一方法。DNA可以在一个平衡的CsCl梯度中通过与以下几个染料中的一个结合而被纯化这几个染料为溴化乙锭、碘化丙锭它们不同的浮力密度对分离不同的染色体组特别有用。
四.PCR小量制备法
此方法的优点是一次可以提纯很多样品，比较快速，而且小于10mg（50mm）的新鲜叶子材料就可以产生足够的DNA，产生的DNA对杂交实验是可用的。这个方法存在的问题是DNA沉淀物可能不够紧密，或不一定能形成一紧密的DNA沉淀。
步骤
1、用1.5ml离心管研磨小的组织样品。可取管口大小的新鲜叶子（10mg）冻在液氮中的叶子也可用。
2、在研碎的样品中加 400µl的分离缓冲液用适合的速度涡旋 10秒钟以分散开样品。
3、在室温下将1.5ml离心管中样品离心 12-15分钟沉淀细胞内物质。
4、收集300µl的上清液弃去沉淀。
5、在上清液中加300µl预冷异丙醇倒转样品1-3次使之充分混合在室温下至少放置5分钟。
6、将微离心管中的样品在室温下离心20分钟以收集沉淀的DNA。
7、弃去上清液用300µl 80%的乙醇室温下沉淀 10分钟。
8、室温下离心样品12分钟弃去上清液。
9、用300µl 80%的乙醇再洗后室温下离心 5分钟弃去上清液。
10、室温下干燥样品1小时或将样品放过夜。
11、用 100µl TE悬浮样品。