1、医院微生物实验室
医院微生物实验室隶属于检验科，主要用于诊断由致病菌引起的疾病如：肺结核，淋病，霍乱，白喉，伤寒，破伤风等疾病
2、药厂微生物实验室
药厂实验室可分为理化实验室和微生物实验室，微生物实验室主要检测药品中微生物数量，确保人们用药安全。
3、食品厂微生物实验室
食品实验室通常也分为理化和微生物实验室，理化实验室主要检测食品中物质含量，微生物实验室主要检测菌落总数及一些特殊种类微生物，确保食品的质量安全。
4.高校微生物实验室
学校微生物实验室主要是用于高校师生对微生物基本操作及生理生化功能研究。一般在高校一个实验室中可进行多种实验操作，微生物培养，PCR操作等都是常见的实验。
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